できれば、2回の旅に分けたほうがいいのですが

１週間では全部空路で2泊ずつしか選択肢はなさそうです。
プラハ、ブダペストからドブロまでの直行便がなければ、ウイーンかザグレブで乗り換えての。

もう1度それらの国に行けるならチェコとハンガリーだけ、またはクロアチアで1週間のほうがいいのですが。
クロアチアはドブロのほかプリトビツェ湖、ダルマチア海岸一周で1週間は必要です。

チェコもプラハとチェスキークルムロフで3日、ハンガリーはブダペストとエゲル、ドナウベント、バラトン湖、ハンガリー大平原（ホルトバージ）などで4日としても、計1週間は必要です。

ただし、中欧へはラストチャンスなら当初の3カ所周遊でもいいかと。