最低２泊

島内で最低２泊、できれば３泊は欲しいです。
エジンバラ１泊で、島内２泊、インヴァネス１泊はどうでしょう。
島内は全部バスでOKなのでレンタカーは要りません。
島も絶景ですが、グラスゴー～マレイグの西ハイランド線、カイル・オブ・ロッハルシュ～インヴァネス間のハイランド線の車窓が英国で双璧のすばらしさなのです。

私の場合、エジンバラ泊、グラスゴー・西ハイランド線経由マレイグ泊(対岸)、島の中心ポートリー泊、島一番の絶景トロッタニシュ半島一周(路線バス)、ハイランド線経由でインヴァネス夜着、夜行(寝台列車)でロンドンでした。

エジンバラは１日がベターですが、半日でも見られなくはないのでスカイ優先で行かれるといいかと。
本当はポートリーからトロッタニシュ半島周遊のツアーバス参加がいいです。