ヨーロッパ鉄道の旅のルートについて、おすすめルート、ビザについても教えてください。

フィンランド、エストニア経由が最高

スウエーデンへの順路はモスクワから列車でサンクトペテルベルク、ヘルシンキ、フェリーでストックホルムです。
フェリーでヘルシンキ、タリン（エストニア）、ストックホルムもいいです。

途中、サンクトペテルブルクとタリンが特に素晴らしいです。
ヘルシンキに着くまで約2週間、エストニア、フィンランド、スウエーデンで2週間余りがいいかと。

横断するだけトランジットビザがいる。

私は、ベラルーシに行ったことがありません。

＞＞もしベラルーシを通るならば、別にベラルーシビザが必要ですか？

以前は必要なかったそうですが、
モスクワなどから列車でベラルーシを横断し列車内にいるだけでも、
トランジット・ビザが要るとあるホームページに書いてありました。

＞＞ロシアビザは取得予定ですが、

このビザをもらうためには、まずロシアのビザが必要になってきます。
そして、ポーランドまでの切符。

事前取得が出来るか調べてみて下さい。
この掲示板でもベラルーシに行かれた方が数名いますから（私の知る限り！）
このトピックを見れば、何かアドバイスをしてくれるかも。