A3 1844

JTR-MUCがその日にあるのは、
A3 1844 JTR 1850 MUC 2035
LH 1765 JTR 1945 MUC 2130

>ミュンヘンでのトランジットが出来なく

ということは、同日FRAへ飛ぶのですよね。

LH 123 MUC 2130 FRA 2230しかないので、やはりA3 1844でしょう。

T2→TなのでなんとMCTは30分。A3 1844が随分遅くなったのでしょう。

もともとMUCでの乗り換えが55分なので、大差ないと思います。まあ、ドイツ国内なら陸路移動も可能で、Flixbusで5-6時間で早朝に着けます。