JAL便名であれば

くろっちさん

ジャル便名であれば、正真正銘の共同運航ですので
搭乗券はスルーで発券できると思います。
私がJALのサイトで検索したところ、ジャル便名ではなく
AZやAFがお互いに共同運行している便を指定してきたので、
どうなんだろう?と疑問に思った次第です。

いろいろな決まりがあって、ほんとうにややこしいですね。