クロアチアは見どころが超多いので別の機会のほうがいいと思いますが

前例がない旅をしてはいけないなんてことはないですが、オーストリア周遊でドブロ1泊は、多分日本人初の旅程になるかも知れません（笑）。
ただし、これが最後のヨーロッパ旅行で、ドブロはどうしても行きたいならゴーでしょう。
行かないほうがいいのは、クロアチアはオーストリアと同様必訪地だけでも最低1週間は必要だからです。
プリトビツェ湖はクロアチア旅行でここに行かない人はいないほどドブロと双璧の必訪中の必訪です。リエカ～ドブロまでバスで12時間のダルマチア海岸はヨーロッパ一美しいといわれるほどなので、ドブロだけというのはもったいないです。

＞移動は捨て時間になるイメージなのですが

これはスイスに行くと通用しないかも知れません。同国の魅力の半分は車窓展望ともいわれるからです。
また、昔調べた辞書には「旅とは移動そのものを楽しむこと」とありましたから、車窓展望のいいところを選んで通ると旅の幅が広がるかも知れません。
市販のヨーロッパ鉄道時刻表にはそのような景勝区間約100カ所が国別に載っています。
それほど遠回りにならない限り、目的地までその線経由で行くと、右も左も絶景で飽きませんよ。
センメリング鉄道経由の路線もヨーロッパ約ベスト１００区間のひとつです。