パスがあるのに、空路やバス利用は2重払いになります

＞飛行機移動があまり好きではないので

と書かれていますよ。

第一、グローバルパス利用で空路などという2重払いする人はいません。
夜行移動はアホらしくなどないですよ。
寝台なら快適ですし、飛行機より速いですから。
寝台は朝到着で朝から観光OK（散策くらいは）。
飛行機は朝か午前便での昼前着がせいぜい。
列車が飛行機に速度で勝つ唯一の方法が夜行なのですよ。
ただ、トピ主さんが相部屋を気にされているので、一人室や4人室がないなら、昼間がいいということです。
伊だけ1週間～10日程度だと、列車移動7時間はもったいないけど、3ヶ月あるので、別に1日くらい移動がメインの日もあってもいいでしょう。