このプランがベストと思います

私がインスブルック経由を提案したのは、ウイーンからザルツブルクに行くのに、センメリング鉄道区間を通りたいために時間は倍かｋるのに、ぐるっと遠回りして行って見たいという方だからです。

確かにウイーンとフィラッハ経由ベネチアを結ぶ、オーストリア第２の幹線のこの区間は景色もすばらしいですが、ダントツの1番はザルツブルク～ツエル・アム・ゼー～インスブルック～(さらにスイス国境のフェルトキルヒまで)とインスブルック～国境のミッテンヴァルト～ガルミッシュです。

よって、ザルツブルクからミュンヘンへもこの絶景区間を通られたほうがいいと思いました。
景色的にはセンメリング鉄道よりはるかにすばらしいので、どちらか1ヶ所ならこちらを通られたほうがいいくらいです。
まあ、またオーストリアに行く機会があれば、そのときでもいいのですが。


最大ザルツブルクで3泊できそうなので、ミュンヘンでの美術館鑑賞時間を全くカットしないで回るのには以下の旅程がいいかも知れません。
ザルツカンマーグートへ冬でも観光可能としたら、ザルツブルクから日帰りを考えておられたと思います。
ただ、カンマーグートの人気の中心ハルシュタットはセンメリング鉄道とザルツブルクの間にあるので、途中下車の形で観光するのが効率的です。

時間的にはハルシュタット散策のあとバートイシュル泊も可能なのですが、荷物の問題があるので、ハルシュタット泊がいいでしょう。
朝の列車かバスでバートイシュルへ。カフェを楽しんだあと、バスでザルツブルクへ昼前後には着けます。
午後観光、泊。３日目午前観光。昼ころのツエル・アム・ゼー経由の絶景列車でインスブルックへ。夕方着、旧市街散策。泊

朝の普通列車でガルミッシュ経由ミュンヘンへ。
これなら前日ザルツブルク泊で朝の直行列車に乗り、ミュンヘンに着く時間とほとんど変わりません。

センメリング鉄道も、カンマーグート(観光計丸１日)も、ザルツブルク(観光計丸１日)、車窓展望も全部できて、しかもミュンヘンでの滞在時間が減ることもない旅程だと思います。

なお、私は他の方のレスにあるような鉄ヲタではなく(沢山いらっしゃるし立派な趣味ですので、それでも全く構わないと思いますが)、トピ主さんとおなじく景色のいい区間があれば、時間がある場合は遠回りはいとわないという単に車窓を楽しむのが好きな人間です。