そのプランで問題ないですよ

クリスマスの頃や年末年始しかヨーロッパに行けない方は大勢います。
クリスマスは日本の元旦(以前は３日まで)のように、食べるところだけでなく、宿まで休みになる所もあり不便なことは確かですが、それ以外は寒くて日が短いだけで、美術館が主なら大丈夫ですよ。館内は暖かいし。

新しい旅程も特に問題はないですよ。
厳しい意見の方はご自分でも書いていましたが、列車の揺れに弱く、半日以上の列車の旅を避け、空路移動だそうです。一晩中乗る寝台など論外ということでしょう。

何度も、３連続(豪州、中国、カナダ)や６連続夜行(シベリア鉄道)にも乗っていますが、夜中に１,２度起きることもある程度で安眠できました。

座席での夜行は薦めませんが、寝台は大丈夫ですよ。
到着した日の夜行ならともかく、２泊しての夜行なら誰でもしています。

クルムロフからウイーンへのバスが出ないこともあるでしょうが、列車でも行けますから大丈夫です。
クルムロフ散策は２，３時間でも可能です。

鉄道パスにするか、早割りなどその都度きっぷの選択はたいした問題ではありません。
自分がいいと思ったほうを選択すればいいだけです。