荷物に関する詳しい記述は航空会社のサイトにあります

　タイトルのとおりです。
　ご存知とは思いますがアラスカ航空のサイトは以下です。ここのホームページ上部にあるメニューのTRAVELINFO以下に荷物に関する詳しい記述があります。

　　　　http://www.alaskaair.com/

　サンフランシスコでの乗り継ぎ時の荷物の扱いについては、まずはアラスカから日本（あるいは最低限韓国）までの通しの航空券なのかどうかです。通しの航空券でしら航空会社間に荷物の引渡しの契約がある場合が多いですから通しでしょう。
　別々に購入した購入件でしたら「一度受け取る」とお考えになっておかれるのが無難でしょう。アラスカでのチェックイン時に「実はこういう乗り継ぎなのだが」と確認されるとよいです。

　なお、往路では荷物が最終目的地まで通しであってもアメリカでの乗り継ぎ時に必ず預け入れ荷物を一度受け取って税関を通らねばなりません。しかし、復路、アメリカ国内またはカナダからの乗り継ぎの場合はその必要がありません。