その時間ならメトロ、バスもあります。

私なら、すぐ宿に直行したいのでタクシーを使いますが、
0:30頃までメトロがありますし、場所によっては市バスの利用もいいでしょう。

リスボン空港周辺はあまり治安が良くない地域なので
夜中、しかも土地勘のない場所で全財産&パスポートを持って
ウロウロするのは危険行為です。
空港から市内中心部まではタクシーで20分程。
料金も10ユーロぐらいですから(荷物をトランクに入れた場合、
その分だけ追加料金がかかりますが)、お勧めです。