チェンマイ空港でバンコクで外に出ると申告する

チェンマイ空港のチェックインカウンターは国際線です。荷物の行き先は日本の到着空港(羽田)です。その場で確認しましょう。
チェンマイでチェックインする時、日本行は夜の便なのでバンコクで出場すると申告しましょう。
バンコクエアでは国内線から搭乗するように案内してくれます。出国審査はバンコクスワンナプーム空港になります。

国内線空港利用料についてはチェンマイでは何も言われないと思います。もちろん必要と言われれば支払わなければなりません。

タイはまだ政情が不安です。その時点の交通事情に注意して余裕をもってスワンナプーム空港に戻ってください。