という事は２．の方法で行きたいようですね

ヴァウチャーの仕組みに納得いこうがいくまいが、この場合予約先からビザ申請用の「オフィシャルなヴァウチャー」を発行してもらう必要があります。Bookin.com経由の予約でその依頼までできるかどうか判りかねますが、できない可能性は高いと思います。

もしそうなら宿泊したいホテルに直接連絡を取り、「オフィシャルなヴァウチャー」の発行を依頼する事です。普通のホテルが個人客相手にこのようなサービスを受け付けるかどうか知りませんが、いくつかのホステルではやっているはずです。ホステルに抵抗がありかつオフィシャルなヴァウチャーを発行するホテルが見つからなかった場合、１．か３．の方法になります。