そこはもう自己責任ということで

　別切りですかぁ。。。　「なぜゆえ、わざわざ」って感じですが、そう決めたのであれば自己責任ですので仕方ないです。
　チェコでのチェックイン時にヘルシンキから先の航空券も示せば搭乗券は出してもらえると思いますし、荷物も通しにできるはずです。
　遅れないことを祈りましょう。

　ちなみに私ならたとえ同一航空会社であっても、1.5時間待ちでの別切り航空券での乗り継ぎは計画しないです。乗り継ぎ失敗の確立は万一(1/10,000)より高いと思うし、それを心配する精神状態が旅の気分に水を注すので。(_ _)