おそらく大丈夫ですが

フランスのTGVなどは、最近運行状態がだいぶよくなっている（現地フランス人曰く）ということなので、おそらく大丈夫と思います。
ただ気をつけたいのは、このTGV5100はCDGが始発ではないので、20分は少しながらリスクはあります。さらにフランスなどは10分くらい前になら無いとホーム番号が確定しないので、慣れていないとあせるかもしれません（LYON PART DIEU発BEAUNE行が始発かどうかは現時点で不明、、すいません）。仮に遅れても一時間後に同等の電車がくるので、その間荷物なり預けて（たしかロッカーがあったような、、、自信無し）、LYONを少し散策するのもいいかもしれません。ベルクール広場（La place Bellecour）までなら十分行って帰れます（がんばればフルヴィエールの丘までいけますが、こちらは十分調べるか、慣れてないとリスキー）。