日本からミュンヘン経由でベルリンまで購入して出発する

もう遅いかもしれませんが、ミュンヘン－ベルリンを別に買うより有利です。
でも出発国が日本かどうかもわかりませんね。

まずは先に回答があったトピに返事をすることが掲示板のマナーです。

Jorgeさんの書いているようにすでに直前なので、現地で購入すれば鉄道でも空路でも高くなります。
早割を利用するならもっと早めに予約しましょう。
ミュンヘン発を翌朝にすれば、すこし安いものがあるかもしれませんね。