ユーロトレインとはなんだか分かりませんが、本家ドイツ鉄道で買えますから無問題ですね

ユーロトレインがマージン（手数料）取ってるからではないでしょうか？
数千円は中間マージンでしょう。

ドイツ以外の他国は知りませんが、ドイツで‘路線が決まっていて日時も変更ないなら’、ドイツ鉄道公式サイトで買うのが一番かと思います。
オンライン発券ですから、超簡単。超便利です。



しかしドイツ鉄道公式サイトも万能ではありません。
鉄道パス（ジャーマンレイルの類）は、オンライン発券は不可能ですし、郵送が必要です。
＊現地窓口でも買えますけれど。

日本に居ながらにして手にするには旅行代理店での購入が便利でしょう。
その場合は中間マージンで価格は多少高くなりますが、日本出発時点から所持して行けることの意義は大きいと思っております。