私は使ったことはないですが

この掲示板でも時々名前を目にしますのでメジャーではあるようです。
Googleで「Agoda 口こみ」とか「Agoda 評判」などと指定して検索すると、いろいろ情報が得られると思います。正しいもの正しくないものが混ざった情報だとは思いますが。
値段だけでなく、キャンセルや変更の取り扱いなどに関する規約などもよくお読みなってサイトを選ばれるとよいでしょう。

ちなみに私がホテル予約サイトを使用する場合、最近はもっぱらbooking.comです。
理由は、、、

　・キャンセル不可の最安値のものは即時支払いだが、それ以外は現地ホテルでの支払いである。
　・地図上に各ホテルの位置が表示され、そこからホテルを選べる機能があるので、はじめて行く街のホテルを選ぶ際に便利。

といったところです。