私ならＴＧで行きます（バンコクに寄りたいんですよね？）

料金は高いかもしれませんが、時間的に効率が良いと思います。

深夜便で日本→早朝バンコク　その日の昼過ぎにはカトマンズに到着します。

帰路は、午後カトマンズ発→夕方バンコク着
翌日の深夜便に乗ると、翌日朝に日本着です。

ネパール３泊で、カトマンズとポカラはきついと思います。

他のレスを読みましたが、４泊でカトマンズ・ポカラ・ナガルコットも厳しい気がします。