公共の交通機関だとやはりタイトな気がするけど、不可能ではないかも

はじめまして！
私も公共の交通機関を使ってタイトな旅行をするほうですが、少しきつい印象を受けました。
旅のスタイルがわからないのでなんとも断言できないですが。

私はザグレブからプリトヴィッツェ、リエカ、ポレチュ、ザダール、シベニク、スプリット、ドブロブニクといき、モルタル、サラエボと移動しました。スロベニアは別の年に行きました。ベオグラードとコトールへは、また別の年にセルビア。コソボ、モンテネグロを旅したときに行きました。

個人的にはベオグラード、ザグレブ、リュブリャナはあまり見所がなかった気がするので、センターだけぐるっとまわって美術館、博物館などの観光箇所で長時間見学をしないならいけるかもしれません。もちろん興味が何にあるかによって変ってきますが。

スロベニアは小さいので、電車かバスの時間を既に調べてあって（調べてないと5日目危ないかも）、朝早くから動いて、目的地でのんびりしないなら4,5日目はいけるんじゃないでしょうか。
私はポストイナの営業時間を調べて行ったのですが、最後のトロッコ乗車は人が何人以上集まらないとだめといわれ、オフシーズンで人が足りなかったため、最小催行人数に達せず、併設の小さい展示室みたいなのを見て帰る羽目になりました。行き交通機関が意外になくて時間を食ってしまったためです。
今は状況が変ってるかもしれないのですが、事前に交通機関の時間を調べていれば安心だと思います。

ポストイナは何もない印象です。街中に小さいレストランやカフェ、バーをみかけたくらいです。私が見落としていただけかもしれませんが。バーでいろんな果実酒のセットを頼んで楽しく飲みました。

オパティア、トロギールはいってないためどれくらい時間がかかるのかわかりません。

スプリットは小さいので周りやすいです。ドブロブニクはやはりゆっくり時間をすごされるのが一番かと。

コトールすごくいいところです。夏に、湾近くの宿に泊まって、ちょっとしたトレッキングをした後に海に飛び込んだりできて最高です。ただし今の日程では無理だと思います。日帰りはもったいないです。モンテネグロはクロアチアと似てますが、さらに手付かずな自然が残っていて、あちこち面白いところ（湾、山、川、海）がたくさんありますので、別の回に時間をかけていくことをおすすめします。ドブルブニクからバスが出てるのでいけなくもないですが、そしたらその前の日程を削ることになります。
モスタルはすっかり観光地かしてますが、それでもきれいでした。こちらもドブロブニクからバスがありますが、同じくその前の予定を変更しないと無理ですね。

とりあえず予定通り旅をし、時間が足りなそうな場合は途中で観光箇所を削るフレキシブルな旅にすればいいかもしれませんね。