レス遅くなりました・・・

1)について
本物？のイスラム教徒は毎日礼拝しますが、トルコ（特にイスタンブル）では軽いイスラム教徒が多いので金曜日のみ礼拝をする場合が多いようです。
毎週金曜日が安息日（キリスト教での日曜日）のような日にあたりますので、金曜日だけはいつも以上に礼拝者であふれかえるはずです。
礼拝時間は毎日数分づつズレますが、お昼なら11:30～12：30の間くらいです。

2)について
飛行機＆バスの時刻を確認していませんので正確には言えませんが、可能としてもパムッカレ到着は夕方以降になりそうですね。

3)について
セルチュクとイズミルなら断然イズミルでしょうね。（調べていませんが・・・）
エーゲ海地方最大の都市がイズミルですからイズミル発着のバスは沢山あるはずです。

4)について
宿については正直経験が無いので憶測でしか判断できないのですが・・・。
スルタンアフメットが観光客には便利が良いのは間違いないのですが、私個人があの辺りが大嫌いなので・・・。
シルケジ駅方面にちょっと坂を下りただけでウザい連中がぐっと少なくなるので私的にはオススメと言っているだけなのです。
実際にあの辺りに宿泊した事は無いのでホテルの質やどこのホテルが良いという情報は一切ありませんのでご容赦ください・・・。