まったく問題なし

飛行機が遅れて次の飛行機に「乗れる、乗れない」の問題以外はまったく問題ありません。

日本人だとしても外国人が日本乗継で一旦日本に入国するのと同じ。

例えば日本人が
日本→韓国→タイ
のルートで、韓国乗り継ぎに一旦韓国に入国するのと同じです。

私も過去に日本乗り継ぎ、日本入国後すぐに第3国に行ったことあります。