グダンスクまでは４時間かと

グダンスクまで６時間もかかりませんよ。ICで約４時間です。工事中だと分かりませんが、通常は４時間です。

クラクフ～ワルシャワも高速列車で２時間半ほどです。
ザコパネ～クラクフは列車は遅いのでバスで２時間（１時間ごと）のほうがいいかと。

乗り詰めは大変なのでワルシャワでランチがてら旧市街散策（タクシーかバスで往復）をお薦めしたしだいです。
夜着になっても２１時ころまで明るい時期だし、１日くらいいいかと。
ワルシャワ１泊がベターですが。

もし、大変なようでしたら、ザコパネだけでもいいかも知れません。