ユーレイルパスについて

ユーレイルパスを使って、１月後半から3月中盤までヨーロッパ一周しようと考えています。
夜行列車に乗りスイスからウィーンに入りたいと考えています。
しかし乗り換えが必要なようで、夜１１時に乗り換え５分というルートが出てきてきます。
そして厄介なことに、５分の間に座席予約をしないといけないようで、駅の窓口で予約していたら乗り過ごしてしまうのではないかと不安になりました。
あらかじめネットで座席を予約する方法を詳しく教えて頂きたいです。
すみませんがよろしくお願いします。