チョベ国立公園からヴィクトリアフォールズ

2泊より3泊のほうがいいです。

2泊より3泊のほうが断然いいです。4泊でもいいと思いますが、そしたらチョベ3泊、ビクトリア1泊、がいいように思います。

新婚旅行なんですね。私も最初のビクトリアの滝、南ア、ケニアなど新婚旅行でした。
サントリーニ島はイアに3泊、4年前に行きましたが、素敵なところでした。きっと素敵な宿を選んでるのでしょう。対照的な場所を選んでますね。フライトの効率が非常に悪そうで、時間とお金が勿体ない気もしますが・・・。
チョベ2泊で、間の日にビクトリアの滝往復だと、ロッジでのんびりできないですね。
私は、朝ゲームドライブして、昼間自然の中のロッジでまったりビール飲んだりコーヒー飲んだりして（ロッジ前の水場の動物見たり）、夕方にゲームドライブ（かボートサファリ）というのが最高の癒しと思ってますので、ぜひ連泊してほしいですね。
サントリーニの素敵なホテルに泊まって、日中ずっとどこかに観光に行って戻って寝るだけ、は勿体ないですよね、それと同じ感じです。
よってチョベのロッジ（？キャンプ？）はよく選んだほうがいいと思います。

チョベに何日滞在されましたか？またビクトリアに日帰りで行く場合、チョベ2泊の滞在というのは無謀でしょうか？
→　無謀ではなく日本人の旅行によくあるパターンと思いますが、勿体ないです。私はチョベにはビクトリアフォールズから日帰りと、厳密にはチョベ国立公園の外のエリアのキャンプに宿泊しかありません。

1日目 13時30分 カサネ空港着
その日にゲームかボートサファリ1回(可能？)
→　十分可能でしょう。

2日目 5時台(早朝の)のゲームサファリ
その後、ビクトリアへの日帰りツアー
可能ならば戻って夕方のサファリ
→　ロッジによっては、夜に別料金でナイトサファリしているので、夕方のサファリに間に合わなくてもこれに参加できたりします。

3日目 5時台(早朝の)のゲームサファリ
14時 カサネ空港発

絶対あるでしょう。

チョベをメインに宿泊して、日帰りでビクトリアフォールズに行くというのは実にいいアイデアですね。
日本のツアーはビクトリアフォールズに宿泊して日帰りでチョベに行く、というパターンしか見たことないですね。私もそうでしたが、逆にすれば良かったと後悔しています。

サッと調べただけでも以下のようなカサネ発のツアーがありました。
（かなり前ですが）チョベゲームロッジやモワナロッジに寄ったことありますが、ロッジからの各種ツアーが貼りだしてあって、当然ビクトリアフォールズへ行くツアーはありましたよ。

https://chobenationalpark.co.za/tour/victoria-falls-day-tour/

チョベだけでなく、オカバンゴやリニヤンティのほうにもぜひ行ってほしいですね。チョベはカサネの町近くのロッジや大型のホテルのような宿が多く、今一つワイルドさに欠けるように思います。

日系はわかりませんが、

各ホテルから、また街中に行くつかの旅行会社があります。
私はチョウべからジンバウェ側の滝に日帰りで行きました。
ツアーは、いくつも毎日出ています。