Re: 空港から市内への移動

1.について
お好みしだいなんで正解はわかりませんが、路線バスを利用するなら29番がいいですよ。
29番はBTS駅の真横に停まり、駅を横断すればアジアホテルですが、59番のバス停は手前の交差点で右折し少し走ったところにあり、ホテルまで結構歩くことになります。
すぐに危険に直面することもないでしょうが、土地勘がないなら、深夜見知らぬ街を歩くのは避けたほうがいいと思います。

2.について
日曜日の早朝ですから、1時間もみておけば十分でしょう。
ただ、そんなに早くからエアポートバスがありました?
むしろアジアホテルの正面に29番バスのバス停がありますから、こちらを利用するほうが便利ではないかと思います。
渋滞がない時間帯なら、所用時間はそうかわりません。

3.について
利用したことがないのでわかりません。

その他
アユタヤ、カンチャナブリに行くなら、バンコクに泊まらずに現地に宿泊したほうが面白いと思います。
アユタヤからカンチャナブリまたはその逆は、半日あれば移動できますし。