モスタル行くべきか悩んでます

7日目の朝、サラエボ行きのバスの乗るべきです

モスタルは復興した橋以外に特に観る物はありません。
折角高いお金を使ってクロアチア、ボスニアまで行かれたのですから限られた日程を有意義に過ごすためにもモスタルをやめてサラエボまで直行された方がよいです。
サラエボに一泊し8日の午後のバスでザグレブに向かわれたらいかがですか。
夜の旧市街の散策はきっと印象に残るでしょう。

ばてぎみだったらやめるべき

旅には体力が基本ですので、しんどい場合は予定をやめてゆっくり過ごすべきだと思います。あとに響きますよ。ダルマチア海岸の夏は暑いでしょう。
モスタル行きは今度の機会に、例えばサライェヴォやベオグラードなどと一緒に、とすれば楽しみが増えるのではないでしょうか（私なら絶対そうします）。モンテネグロにも今回行かれないのでしょ。

迷わず

　行くべきでしょう。

モスタルに立ち寄るならサラエボ

スケジュールにはサラエボが入ってませんがご予定はないのですか。
内戦後間もない時ならモスタルに立ち寄り現状を観ても考えさせるものがありましたが
いまは改めて立ち寄るほどでもないと思います。
ボスニアヘルツボビナにはこの18年間に何度となく行きましたがドブロブニクからサラエボまでの
バス移動の途中モスタルを通りますので車窓から眺める程度でもよろしいのではないでしょうか。
今はだいぶ復興がすすみ内戦の悲惨な跡形がなくなりました、ツーリストにとっては過ごしやすい場所です。
サラエボへの立ち寄りをお勧めします、サラエボから最終地ザグレブへはバス移動が楽です。

ご参考まで

悩ましいところですね。およそ一月前に定期バスで行きましたが、おっしゃるとおりパスポートコントロールにかなり時間を食われました。途中トイレ休憩は1回ありました。私たちは一泊しましたが、一泊して正解だったと思います。日帰りだと年齢的にきつかったでしょう。モスタルはドブロブニクと異なり、見所がふんだんにあるわけではなく、例の橋の周辺に集中していますので、見学に時間は要しません。もし行かれたら、対岸のレストランの間の小道から川辺に降りることができますので、是非下から見上げてみることをお勧めします。実に優美ですよ。このときは、わざわざ来て良かったと思いました。ご参考まで。

何を見る旅、経験する旅にしたいかでしょう

　タイトルのとおりです。
　ご自身の趣味・嗜好などを踏まえ、ご自身で判断すればよいことではないでしょうか？
　ドブロヴニクの終日観光を入れられてあるので「もう1日は何処かへ」というのはありだとは思います。
　なお、何時頃お出掛けなのかわかりませんが、所要時間に関してはバカンスシーズンだとパスポートコントロール云々より交通渋滞のリスクの方が大きいです。

こればかりは価値観次第！

私は橋の景観が好きで昼と夜両方見に行きました。

話は違いますがエクアドルに行った時、ラスサハス教会を見に
片道５時間かけて行きました。
https://retrip.jp/articles/578/
このように人それぞれなので正解は本人しか判らない事です。