シンガポール経由が時間のロスが少なくお薦めです。

　下のレスにある、シンガポール航空が子会社のシルクエアーでプーケットと結んでおり、自分は名古屋でしたが、時間のロスが一番少なく、時にはタイ航空よりも安い場合もありました。

　あと、値段と時間を考えた場合、マレーシアも考えられますが、、、
http://www.ab-road.net/air/schedule/
のサイトでフライトスケジュールを検索いただきそのあと、http://www1.tour.ne.jp/search/air/air_sch.html
で値段を調べてから買うのが基本線だと思います。