島では決められません。

　各島の中にも一杯ダイビングポイントがあって、ポイントごとに海底の様子が違っていたり、生息する魚も違うことが多いので、一概にこうだということは言えません。
　でも、何処でもフィリピンの海は透明度は良いと思います、天候しだいですが。
　行き易い、安いところを選ばれれば良いのではないでしょうか。
　東京から一番安く行けるきれいな海は、沖縄ではなくてサイパンですので、調べてみてください。

http://www.ab-road.net/
　
のダイビングから検索してみてください。