答えが出ました。

宿泊予定のホテルの方が返事をくれて、鉄道駅前のヴァポレット切符売り場は夜11時半までやってるらしいことが判明。荷物も、切符の種類に関わらず、キャスターのついた小ぶりのキャリーケースくらいなら無料で乗せてもらえるだろうとのことです。ただ「等身大のスーツケースはチャージされるだろう」というコメントに、そんな大型荷物持ってく人いるか?とツッコミ入れたくなりましたが。。。　ちなみに、やはり船上では1回券しか購入できないそうです。