効率を考えると・・・

インスブルック経由で迂回するルートもありますが、
支線を通るので乗換えや便数が少なく不便だと思います。

やはり幹線で便数が多いザルツブルク経由でミュンヘン
まで出て、フュッセンに行くのがベターと思います。
時間はかかっても別ルートをというのであれば、話は別
ですが・・・。

ミュンヘンからノイシュバンシュタイン城などを見物する
現地ツアーが出ているので、これを利用するのも良いかも
しれません。↓

http://www.his-germany.de/jp/optional_germany.htm#muc

過去、フュッセンからサイクリングでお城見物をしたこと
がありますが、その折の詳しい旅行記がありますので、次
を参考にご覧ください。

http://yasyas.web.infoseek.co.jp/
（ドイツ編をご覧ください）