お役に立てるか分かりませんが…

【トラベルコちゃん】
http://www.tour.ne.jp/

私はいつもこのサイトから航空券を手配しています。
手配は少しでも早いほうが融通が利きますよ。
ネット上で記載されていても、実際はチケットが売り切れていたりもしますから、
まずは目ぼしい所へお問い合わせだけでもされてはいかがでしょうか。

燃料費などの諸経費がまちまちな理由は分かりませんが、
問い合わせ時に、総額いくらかかるのかを確認しておけば、
最も安く、自分のニーズにあった航空券を探し出すことができると思います。