ご参考までに

鉄道は、オーストリア内はサクサク行きますが、チェコではたまに遅れることがあります。たいていの場合は、時刻表通りに行きますが。
工事か何か知りませんが、いったん鉄道を下ろされてバスに乗り換えし、別の駅まで連れて行かれまた鉄道に乗り直すこともよくあります。
その場合は、手持ちの切符があれば十分です。英語を話す人はほとんどいませんが、車掌さんも知らせてくれますし、周りについていけば大丈夫です。

http://jizdnirady.centrum.cz/?tt=J&cl=C&p=NC

チェコ語のサイトですが、途中から英語も選択できます
バス、鉄道、両方の時刻表が検索できます

バスの方が早くて便利だと思います
ただ、初めての土地で、かつチェコでは英語はほとんど通じないので、鉄道の方が安心だとは思います