ちゃんと計画通りに行動できるならば

>DBのサイトを見ると、乗車車両を限定すればかなり安い価格で乗車できるような感じですが、織り交ぜて行ったほうがいいのでしょうか？

時間に余裕を持って、ちゃんと計画通りに行動できるならば、列車指定の早割切符を買った方が良いです。しかしこの切符は文字通り列車指定ですから、早く駅に来れたからと言って早い時間の列車に変更することはできませんし、乗り遅れたらそれまでで切符はただの紙切れになります。定刻着陸であってもいつ空港から出られて駅のホームまでたどり着けるか計算できない飛行機で到着直後の移動でしたら、わたしならこの切符は買いません。

いまこのコメントを書きながらDBの検索ページでシミレーションしてみましたが、割引切符が使えるのはフランクフルト-ミュンヒェンのみでした。ですから飛行機延着のリスクをどう考えるかが割引切符を使うかどうかの判断の分かれ目だと思います。