クラクフに行かなければ、昼間移動で楽な旅になりますよ。

>>現地で当日や１日前でも寝台は簡単に予約できますか？
>>もし、問題がないようでしたら現地で購入したいと思っています。

帰国日が決まっている短期旅行ならば、無事帰国が絶対条件でしょうね。

だとしたら、軽々に切符が取れる取れないは、他人が言うことではないです。
特にクラクフからの夜行列車は本数が限られていますからね。

旅行ではトラブルが起きることを予想しておく方がいいです。
短期旅行ならば、できるだけ余裕を持って、無理のない計画を立てたほうがいいです。

全体の旅行計画がわかりませんが、
クラクフに行くから夜行列車に二回も乗るわけですよ。

ですから、クラクフに行かないで、
「午前移動で午後に町について、ホテルに入って、午後に観光」
を繰り返す計画を立てたほうがいいのでは？

ところで、

>>プラハ⇒ウイーン

は、昼間移動で4時間ですよ。
ここを夜行で行く意味はないです。
日帰りだって可能です。

もうすでに、航空券は手配されているでしょうが、
ヨーロッパ地図を見て、そのインとアウトの町を
ルートを考えた方がいいとおもいます。

中身のないことを書きましたが、実は、この質問に答えるために、
トーマスクックを開いて、あれこれ調べたので（笑）。

こちらに、ヨーロッパ鉄道について、主に僕が「地球の歩き方」で書いた話をまとめてます。
http://jbbs.livedoor.jp/bbs/read.cgi/travel/5919/1144017932/

参考にしてください。

みどりのくつした