Re: 九月の中欧旅行について教えてください

　この旅程を所与の条件とすれば、最も(時間的に)効率の良い交通機関の利用法は、オーストリア・チェコの2ヶ国からクロアチア・ボスニアの2ヶ国への間は飛行機利用でしょう。この2地域間にはアルプス越えがあるので、陸路だと時間がかかります。ハンガリー平原を通れば険しい山地を避けることができますが、道路・鉄路ともオーストリア経由に比べて遅くなります。
　空路はプラハやウィーン、ブラチスラヴァからクロアチア方面にフラッグキャリアもLCCも多数の便がありますので、LCCサイトや空港サイトから検索してみて下さい。但し、9月だと休暇のピークを過ぎるため、特にLCCは便数(・路線)が減る可能性が高いです。
　ただ、もし多少なりとも時間に余裕があれば、景色を楽しみながら列車で移動するのも悪くないと思います。

　ご質問の2点目のオーストリアからプラハへの移動についてですが、ウィーンからということでしょうか。
　そうであれば、事実上飛行機または列車に限定されます(バス便は極めて少ない)。ウィーン市内に一旦出てからプラハに移動するなら鉄道が便利でしょう(前売の安いチケットが国鉄OeBBのサイトwww.oebb.atから検索・購入可能)し、直接プラハに向かうなら飛行機が便利でしょう(ウィーンin/outで1区間追加できるチケットなどの場合、追加支出も少ないでしょう)。

　楽しいご旅行を。