バスに一票

ブラチスラバ中央駅の雰囲気はあまりよくありません。
地元の人でも、ドナウ川対岸のペトルジャルカ駅を薦めます。
ガイドブックには、
ペトルジャルカは雰囲気が悪い、とありますので、
ある意味五十歩百歩といえなくもないですが、
ウイーン方面への利便性ではこちらのほうがよいようです。

ブダペシュトでいうと、
ケレンフェルディ駅に相当するような感覚でしょうか?

ペトルジャルカの場合、距離的にバスを使わなければ、
中心部へ出るのは難しいので、

結局のところ、
バスでバスターミナルにつけるほうが簡単だと思います。

駅はともかくも、街中の治安は問題ないと思います。
ウイーンよりは明らかに安全です。
首都とはいえ田舎町程度に考えておいたほうがよいでしょう。