トルコが通過だけなら

イランのビザは発給から3ヶ月間有効です。
ヨルダンで取得しないご事情は?

一時トルコ/イランの国境で取得できた時期もありました。
できればその方が楽ですね。
ヨルダンのイラン大使館で確認されてみては如何でしょう。