NZの国際線乗り継ぎのことでしょう(誤解でしょう)

サイトに出ているのは、

NZ90便またはNZ98便でクライストチャーチからオークランドに飛んで、
ここから国際線に乗る客に関する記載だろうと思います。

「ご出発のお客様は、クライストチャーチ空港の出発ターミナルが国際線
ターミナルとなりますのでご注意ください。国際線のチェックインカウン
ターで、ご出発の60分前までにチェックインをお済ませください。」

乗ろうとしているのはSQ298 CHC 1200 SIN 1730なので、全く異なる
チェックインになります。この場合、SQ側は国内線からの乗り継ぎ客が
居るか居ないかの情報は持たず(別切りの原則)、また気にもしません。
出発時間になれば飛んでいくだけ。ただし、一冊の航空券(予約記録が
一つ)ならば、待つか、仮に置いてけ堀になっても救済はしてくれます。

SQに伝えることは可能ですが、待つ義務もないのです。

無関係に買い集めた航空券ならば、遅延のさいには紙くずになる可能性
(危険性)は始めからあり、客はそれを納得の上で購入するのです。