1988年でも(東ドイツ内の鉄道で)6時間でしたからねー。

僕が1988年にベルリンからプラハへ移動した時、
1988年で、東ドイツ内の鉄道で移動しても、
6時間でした。

今ならばもっと速いと、別の人も書いてます。
短い時間を夜行列車で移動するのは大変です。
このルートは、昼間移動がいいでしょう。

西ベルリンから東ベルリンへ、さらに鉄道でプラハへ@チェコ(チェコスロバキア)
http://www.midokutsu.com/europe/prague.htm

ただもし、列車内で寝て宿泊代を浮かすのが目的ならば、
もう少し遠いところへ行って、戻ってくるというテクニックもありますよ。

みどりのくつした