日本語のところに、こう書かれていました。

>どうも、Japan　と　ニッポン　の関係なのでしょうか。
自分たちは、「クロアチア」と呼んでいない感じですね。

確かに、Japanとニッポンの関係のようです。

Wikipediaの日本語の所には以下のように書かれていました。

国名
正式名称はクロアチア語で、Republika Hrvatska。通称 Hrvatska(フルヴァツカ)。 ネクタイはもともとクロアチア人の風習であったことから、クロアチアに由来する名称でネクタイを指す言語もある(フランス語:cravateやスペイン語:corbataなど)。

公式の英語表記は、Republic of Croatia(リパブリック・オブ・クロエイシア)。通称、Croatia(クロエイシア)。

日本語の表記は、クロアチア共和国。通称、クロアチア。