ICEをお薦めします。

のんのん★さま。ぐーてんたーく!

私もICEをお薦めします。

でも、できればさすけねえ様と同じ理由でフランクフルト市内の宿泊をお薦めします。市内から空港まではS-Bahnで20分の距離です。
Hotelもミュンヘンよりフランクフルトの方が割安です。

もし、ミュンヘンの宿のキャンセルができないということでしたら、Gorge様と同じように、空港ターミナル1の隣にある長距離列車駅(Frankfurt (M) Fernbahnhof)へ直接乗って行かれるといいですね。