結構自信の有る意見です。

道は過去より良くなってるでしょうが、問題は道じゃなくバスでしょう。
あのバスが新型に切り替わったと言う情報は聞きません。
私は5年ほど前に夜8時くらいに着いた事も有りますし、
2005年頃夜12時に着いた事もあります。

トピ主さんは時間を重視されているようなので、
とりあえず公営バス、国境を越えてタクシー、
もしタクシーを見つけられない&ステーションに行けないなど問題あれば、
バスに乗ってシェムリアップを目指す、ということでいかがでしょうか。

安全面に関しては、過去はポイペト発で問題が多かったのは確かですが、
ここ1年から2年では私が乗るときはいつも1人の女性なんかもいます
(カンボジア人)
2人分のシートを1人で座る金持ちが増えてますし、
スリにさえ気をつければ問題はないような気がします。
むしろ国境からタクシーに乗るリスクより、
ツアーバスのため国境で長時間を過ごす方が様々なトラブルに遭遇する可能性が高いと思います。
速やかに国境を抜け、雑踏から離れたところでタクシーかバスかを判断するのも悪くないと思います。