Re: ジョグジャからジャカルタまでの交通手段

時刻表と価格はこちらで検索できます。現地鉄道会社サイトです。
http://infoka.kereta-api.com/

長距離列車は外国人もよく利用しているので、普通に貴重品管理などに気をつけていれば安全面に特に問題はないですよ。私も一人旅で何十回と乗ってますが、問題があったことは一度もありません。
1等やエグゼクティフを取れば座席指定で、途中駅でも物売りは立ち入り禁止なので、より安心だと思います。チケットに軽食や食事も含まれています。エアコンが効きすぎていることが多いので、羽織るものもあった方がいいですよ。