不確かなことで申し訳ありませんが…

オンラインでも予約できると思いますよ。

SBBのHP見ると、チケットはPDFファイルの形式で画面表示されるので、それを自分で印刷(A4サイズ)して持って行くかたちになると思います。
私はドイツ鉄道のチケットを同じように予約したことがあります(Glacier Expressのチケットは窓口で予約しましたがorz)。

もしかして、こにゃんこさんのパソコンにPDFファイルを表示するために必要なソフトであるAcrobat Reader(無料)がインストールされていないのでは?

日本の感覚からすると自分で印刷したものが、チケットとして使えるのか?と思うかもしれませんが、ドイツやスイスは、車内改札(いわゆる検札)の場合が多いので、必要な情報が載っていればチケットとしてOKです。改札機を通すわけではないので、チケットのサイズや体裁はあまり関係ありません。
余談ですが、私が以前、ドイツで泊まったホテルでは、市内の鉄道が無料になるサービスを宿泊者にしていたのですが、そのときは部屋のカードキーがチケット代わりでした。