フランスレイルパス

ベルサイユへツアーで行くようなら、勧めませんでしたが、シャルトルへも電車で行くというので、他も電車で行けると思いました。駅の窓口でフランスレイルパスを見せTGVの予約をするだけですから。
フランスレイルパスは国鉄のTGVや特急に乗り放題のパスです。TGV以外は予約不要です。3日パスは25歳までなら2万円、以上でも2万7100円です。MSMへのツアー1本分より安いかと。レンヌからMSMへのバス代は必要ですが。

MSMへはパリ発7時頃のTGVで。19時頃戻れます。9時発だと21時くらいになります。ツアーでも早朝発ですから7時発で。
シュノンソーへの列車は2時間ごとくらいと少ないので、トゥール発9時15分のに乗るといいです。