Re: オフシーズンのギリシャ

全体の旅行のアウトラインがイマイチ解りませんので、想定交え解る範囲で。。。

もし、トルコ日程に余裕(合わせて全体でもOK)があるのならロードスへはトルコ(マルマリス)から高速艇で行けます。トルコの観光場所でマルマリス近辺へ行き(パムッカレ≒デニズリからは比較的近い)日程が合うならアテネ側から行くより近いです。ただし、この時期週2便(これが全てでは無いと思いますが少ないはずです)のようなのと船旅って感じでは無いですが。可能性として上げときます。
http://rhodes.marmarisinfo.com

あと、ギリシャ(ピレウス)港発ですとロードス、クレタ往復共半日の夜行便になるかと思います。夜行だと景色等見れないので船便で行く価値があるかどうかは考慮した方が良いでしょう。
長距離なので比較的大きめのフェリーと思いますので風の影響は少ないかも?と推測しますがフェリーの場合日程的には余裕を持つのは基本です。風がでれば空路でもスケジュールは狂います。(ただし、空路は1日何便もありますが)
最後かつかつに島の日程が入るのは避けるのが無難。
トルコからの入国がアテネINの空路なので先に島観光して、調整代を後で取れる方が良いでしょう。トルコから陸路で北からギリシャINの場合テッサロニキ、メテオラ(行く場合)はルート上合理的ですがすでにアテネINのAir取っておられる?ようなのと、最悪そちらを島より後にする事で行程調整が可能なので。(つめるか諦めれば良いので)
調整代を見るならフェリーでも良いと思います。最悪現地で飛行機利用も含め考えれば(その場合皆もそうするので混みますが)いずれかの手段で次の日には帰れると思います。クレタの方が飛行機も大きく、便数も多いので候補として無難ではあります。(無難で決まるもので無いので行きたければロドスで良いとは思います)

ただしロードス、クレタ両方行くのは今の日程では飛行機使ってもキツイと思います。宿泊せずに朝-夜便で日帰りで良いなら可能ですが。。。
又、テッサロニキ、メテオラに両方滞在するなら島へ行く事自体がしんどいですね(不可能ではありませんが、行って帰ってという余裕の無い行程になります。結構離れた場所ばかりなので移動だけで終わります。フェリーが夜行なので飛行機使っても体力以外時間的にはあんまり変らなくなるはず。逆に不利かもしれません)。アテネが一番魅力ないので個人的には落としたいですが、行程上も常識上も無理ですねw。(笑)

ちなみに、クレタ行きは毎日あるはずですが、ロードス行きフェリーは往復共毎日無いと思うのでフェリーサイト等で確認下さい。
http://www.gtp.gr/RoutesForm.asp

ホテルに付いてはオフシーズンですがキクラデス(ミコノスとかサントリーニ)の様に小さな島で無いのであいてるホテルはあります。特にクレタは大丈夫でしょう。

バス、列車移動の安全性については夜行であればバスの方が安全でしょう。旅情は列車の方があります。。。ただし、どちらでも貴重品には気をつければ避けねばならないほど危険とは思いません。深夜着のバスステーションの周りは寂しい事が多いのでそれは避けるのが無難。そこからTAXIに乗るとほぼ間違い無くぼられます。

私であればテッサロニキとロードスを落としたプランとします。(テッサロニキは個人的にヨーロッパでも好きな街ですが・・・人に勧める場合でどちらか問われればメテオラ。テッサロニキは何日か滞在するならコンパクトで居心地良い街ではあります)
特にAirでアテネに入るので(陸路なら行程途中ですが)テッサロニキに足伸ばすのは(空路を使っても)ロスが大きいです。テッサロニキに思い入れが無いのなら他の所を充実させた方が、旅行全体としては良いのではないか?という意見。

本当は日程上は陸側、海側で分けてアテネ(及び近郊)以外は欲張らずどちらか選択がBestと思いますが、気持はわからないではないので。島が諦めれるなら今の時期なら島側をサックリ落とすのがほんとは無難でしょう。そうすればメテオラ、テッサロニキ、アテネ近郊も廻れます。