調べてみたのですが

調べてみたのですが、アッシジから直接行く方法はなさそうですよ。
レンタカーしかないようです。
サンジミニャーノへ行く手段は少なくてフィレンツェから行くにしても
POGGIBONSIで一旦バスに乗り換えて向かうことになります。シエナから
にしても同様です。今、バスの時刻表が手元にないのですが、
ご参考までにご案内のページを見つけましたので貼付しておきます。

http://sazanka.sakura.ne.jp/~stand/guide/sanjim/locate.html