一応船のルートはありますが....

乗ったことはありませんが、イタリアに住んでいるギリシャ系の人が
利用したりする船のルートはあります。

http://www.ferries.gr/

ただしお役にたつかどうか....。かなり南のプーリア、カラブリアあたりになるとギリシャとの距離はちかいですが、その港までの移動がかなり面倒になるかと思います。