何とも言えないが・・・

VISAのNOや有効年月の手書き修正の場合はヤバイと思いますが
パスポートNOは本物と照合するので問題ない筈です。

間違いの原因も大使館以外有り得ない事が明白です。
修正したと言う事はデータとの違いを確認した結果と思います。

なのでイミグレもその辺の事は承知していると思います。